1．政府扶持力度小粤港一体化中小企业的机遇。一是国家对中小企业扶持力度不足。二是法律不健全，中小企业的合法权益难以保障。三是政府职能还没有彻底转变，服务保障体系不健全。
2．社会化服务体系不健全。在我国，为中小企业服务的中介机构发展较晚，不够完善。另外，已有的中介机构往往依附政府部门，即使对企业开放，也多为大企业服务。而新成立的一些商业性较强的中介公司，虽然对所有企业开放，但服务费用高昂，中小企业难以承受。
3. 融资困难。一方面，金融机构对中小企业“惜贷”现象严重。目前四大国有商业银行的信贷资金主要流向大型企业。另一方面，在资本市场上，中小企业由于无法达到在股票市场上融资的条件，直接融资的渠道受阻。
4．知识产权保护面临困难。中小企业大都无法设立专门的知识产权保护机构，也无专门人才及专项保护基金来应对侵犯行为。由于政府及司法部门的保护力度有限，中小企业也难以承担知识产权纠纷所需的巨额诉讼费用，因此，一旦知识产权被侵犯，中小企业就会丧失从创新投资中获取收益的机会，导致企业竞争能力的丧失。另外，很多中小企业难以承担申请专利所需的较高费用和较多的人力和时间，担忧在申请过程中出现技术秘密的泄露，因此，随着更多的中小企业进入高新技术领域，中小企业知识产权的保护将变得更加困难。
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